Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRN3Q13033 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN3Q13033 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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