Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PRDM2Q13029 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC36.9■■■■□ 3.5
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