Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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