Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN1Q12860 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
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