Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPQ12770 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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