Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC38.32■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC38.3■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
HMGXB3Q12766 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC38.24■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC38.23■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC38.23■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
HMGXB3Q12766 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
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