Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAGPQ0VAQ4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms