Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms