Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms