Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 327.1 ms