Protein–RNA interactions for Protein: Q08003

RFU1, Regulator of free ubiquitin chains 1, yeastyeast

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RFU1Q08003 PCL6YER059W 1263 nt2.6□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 YGL262WYGL262W 528 nt2.6□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 YHL005CYHL005C 393 nt2.6□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 YHR180WYHR180W 492 nt2.6□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 DAL2YIR029W 1032 nt2.6□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 RPL19BYBL027W 570 nt2.6□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 SNO1YMR095C 675 nt2.6□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 RPL20BYOR312C 519 nt2.6□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 OXR1YPL196W 822 nt2.6□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 YFL040WYFL040W 1623 nt2.6□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 SWC4YGR002C 1431 nt2.59□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 MET6YER091C 2304 nt2.59□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 JJJ1YNL227C 1773 nt2.59□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 XRN1YGL173C 4587 nt2.59□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 YGR015CYGR015C 987 nt2.59□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 QCR10YHR001W-A 234 nt2.59□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 YKR011CYKR011C 1062 nt2.59□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 HHF2YNL030W 312 nt2.59□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 TAF3YPL011C 1062 nt2.59□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 ARA1YBR149W 1035 nt2.59□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 ARO4YBR249C 1113 nt2.59□□□□□ -1.99
RFU1Q08003 SIR1YKR101W 1965 nt2.59□□□□□ -2
RFU1Q08003 UBP14YBR058C 2346 nt2.59□□□□□ -2
RFU1Q08003 EPL1YFL024C 2499 nt2.59□□□□□ -2
RFU1Q08003 SPP382YLR424W 2127 nt2.59□□□□□ -2
RFU1Q08003 ESL1YIL151C 3357 nt2.58□□□□□ -2
RFU1Q08003 CAF120YNL278W 3183 nt2.58□□□□□ -2
RFU1Q08003 HRD1YOL013C 1656 nt2.58□□□□□ -2
RFU1Q08003 DBP10YDL031W 2988 nt2.58□□□□□ -2
RFU1Q08003 FIN1YDR130C 876 nt2.58□□□□□ -2
RFU1Q08003 MRPL25YGR076C 474 nt2.58□□□□□ -2
RFU1Q08003 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.58□□□□□ -2
RFU1Q08003 MRPL49YJL096W 486 nt2.58□□□□□ -2
RFU1Q08003 YJR111CYJR111C 852 nt2.58□□□□□ -2
RFU1Q08003 SDH3YKL141W 597 nt2.58□□□□□ -2
RFU1Q08003 PBA1YLR199C 831 nt2.58□□□□□ -2
RFU1Q08003 YAR069CYAR069C 294 nt2.58□□□□□ -2
RFU1Q08003 AAR2YBL074C 1068 nt2.58□□□□□ -2
RFU1Q08003 AIM39YOL053W 1188 nt2.58□□□□□ -2
RFU1Q08003 TRM1YDR120C 1713 nt2.57□□□□□ -2
RFU1Q08003 CIK1YMR198W 1785 nt2.57□□□□□ -2
RFU1Q08003 SRP68YPL243W 1800 nt2.57□□□□□ -2
RFU1Q08003 RPL6AYML073C 531 nt2.57□□□□□ -2
RFU1Q08003 MDJ2YNL328C 441 nt2.57□□□□□ -2
RFU1Q08003 ICR1ICR1 3199 nt2.57□□□□□ -2
RFU1Q08003 YLR278CYLR278C 4026 nt2.57□□□□□ -2
RFU1Q08003 CNA1YLR433C 1662 nt2.57□□□□□ -2
RFU1Q08003 UTP14YML093W 2700 nt2.56□□□□□ -2
RFU1Q08003 ERG26YGL001C 1050 nt2.56□□□□□ -2
RFU1Q08003 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.56□□□□□ -2
RFU1Q08003 PPX1YHR201C 1194 nt2.56□□□□□ -2
RFU1Q08003 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt2.56□□□□□ -2
RFU1Q08003 MTR2YKL186C 555 nt2.56□□□□□ -2
RFU1Q08003 RSA3YLR221C 663 nt2.56□□□□□ -2
RFU1Q08003 RPL20AYMR242C 519 nt2.56□□□□□ -2
RFU1Q08003 LCL1YPL056C 306 nt2.56□□□□□ -2
RFU1Q08003 SOK1YDR006C 2706 nt2.56□□□□□ -2
RFU1Q08003 POL31YJR006W 1464 nt2.56□□□□□ -2
RFU1Q08003 SDS23YGL056C 1584 nt2.56□□□□□ -2
RFU1Q08003 RIX1YHR197W 2292 nt2.56□□□□□ -2
RFU1Q08003 NMD2YHR077C 3270 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 RTK1YDL025C 1863 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 MRH1YDR033W 963 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 NKP1YDR383C 717 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 TOS8YGL096W 831 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 THP2YHR167W 786 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 YKL222CYKL222C 2118 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 AHP1YLR109W 531 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 SFH1YLR321C 1281 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 MRPL16YBL038W 699 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 PSY2YNL201C 2577 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 DBP5YOR046C 1449 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 DSF2YBR007C 2211 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 VPS30YPL120W 1674 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 TPK2YPL203W 1143 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 YPR053CYPR053C 456 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 RIF1YBR275C 5751 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 YIL169CYIL169C 2988 nt2.55□□□□□ -2
RFU1Q08003 BUD30YDL151C 582 nt2.54□□□□□ -2
RFU1Q08003 COS7YDL248W 1152 nt2.54□□□□□ -2
RFU1Q08003 HPA3YEL066W 540 nt2.54□□□□□ -2
RFU1Q08003 GPP2YER062C 753 nt2.54□□□□□ -2
RFU1Q08003 COS5YJR161C 1152 nt2.54□□□□□ -2
RFU1Q08003 ALG5YPL227C 1005 nt2.54□□□□□ -2
RFU1Q08003 IKI3YLR384C 4050 nt2.54□□□□□ -2
RFU1Q08003 YPL109CYPL109C 1974 nt2.54□□□□□ -2
RFU1Q08003 CWC22YGR278W 1734 nt2.54□□□□□ -2
RFU1Q08003 DSE4YNR067C 3354 nt2.53□□□□□ -2
RFU1Q08003 HEH2YDR458C 1992 nt2.53□□□□□ -2
RFU1Q08003 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.53□□□□□ -2
RFU1Q08003 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.53□□□□□ -2
RFU1Q08003 TIM21YGR033C 720 nt2.53□□□□□ -2
RFU1Q08003 YGR107WYGR107W 450 nt2.53□□□□□ -2
RFU1Q08003 MTM1YGR257C 1101 nt2.53□□□□□ -2
RFU1Q08003 IRC18YJL037W 675 nt2.53□□□□□ -2
RFU1Q08003 YKR047WYKR047W 306 nt2.53□□□□□ -2
RFU1Q08003 YLR326WYLR326W 723 nt2.53□□□□□ -2
RFU1Q08003 ILV5YLR355C 1188 nt2.53□□□□□ -2
RFU1Q08003 MPD2YOL088C 834 nt2.53□□□□□ -2
RFU1Q08003 YPL216WYPL216W 3309 nt2.53□□□□□ -2
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