Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms