Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC3A1Q07837 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms