Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX8Q06710 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX8Q06710 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms