Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNB3Q05901 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms