Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms