Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms