Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms