Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms