Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
MS4A2Q01362 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms