Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1BQ00975 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1BQ00975 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms