Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
CLTCQ00610 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLTCQ00610 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms