Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXC5Q00444 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms