Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VLDLRP98155 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VLDLRP98155 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms