Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX1P83916 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX1P83916 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX1P83916 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX1P83916 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX1P83916 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX1P83916 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX1P83916 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX1P83916 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX1P83916 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX1P83916 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX1P83916 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX1P83916 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX1P83916 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBX1P83916 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBX1P83916 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBX1P83916 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX1P83916 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX1P83916 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX1P83916 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX1P83916 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX1P83916 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX1P83916 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX1P83916 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX1P83916 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX1P83916 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX1P83916 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX1P83916 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX1P83916 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX1P83916 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX1P83916 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX1P83916 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX1P83916 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX1P83916 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX1P83916 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX1P83916 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX1P83916 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX1P83916 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX1P83916 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX1P83916 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX1P83916 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX1P83916 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX1P83916 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX1P83916 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX1P83916 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX1P83916 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX1P83916 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms