Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms