Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB4BP68371 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB4BP68371 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms