Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA1P68133 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms