Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBX1P62877 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBX1P62877 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBX1P62877 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBX1P62877 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms