Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNB1P62873 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GNB1P62873 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB1P62873 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB1P62873 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB1P62873 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB1P62873 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB1P62873 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB1P62873 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB1P62873 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB1P62873 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB1P62873 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB1P62873 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB1P62873 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB1P62873 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNB1P62873 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB1P62873 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms