Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERVK_113P62684 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms