Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNRPD1P62314 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms