Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP25P60880 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms