Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
ROMO1P60602 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms