Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPI1P60174 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPI1P60174 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPI1P60174 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPI1P60174 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPI1P60174 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPI1P60174 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPI1P60174 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPI1P60174 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPI1P60174 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPI1P60174 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPI1P60174 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TPI1P60174 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPI1P60174 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPI1P60174 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPI1P60174 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPI1P60174 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPI1P60174 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPI1P60174 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPI1P60174 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPI1P60174 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPI1P60174 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPI1P60174 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TPI1P60174 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPI1P60174 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPI1P60174 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPI1P60174 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TPI1P60174 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPI1P60174 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPI1P60174 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPI1P60174 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPI1P60174 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPI1P60174 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPI1P60174 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPI1P60174 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPI1P60174 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPI1P60174 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TPI1P60174 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPI1P60174 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TPI1P60174 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPI1P60174 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TPI1P60174 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPI1P60174 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPI1P60174 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPI1P60174 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPI1P60174 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPI1P60174 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPI1P60174 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPI1P60174 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPI1P60174 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPI1P60174 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPI1P60174 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPI1P60174 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPI1P60174 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPI1P60174 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPI1P60174 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPI1P60174 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPI1P60174 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TPI1P60174 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPI1P60174 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPI1P60174 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPI1P60174 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPI1P60174 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPI1P60174 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms