Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms