Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX16P57768 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX16P57768 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX16P57768 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX16P57768 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX16P57768 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX16P57768 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX16P57768 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX16P57768 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX16P57768 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX16P57768 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX16P57768 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX16P57768 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX16P57768 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX16P57768 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX16P57768 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX16P57768 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX16P57768 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX16P57768 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX16P57768 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX16P57768 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX16P57768 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX16P57768 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX16P57768 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX16P57768 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX16P57768 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX16P57768 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX16P57768 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX16P57768 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX16P57768 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX16P57768 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX16P57768 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX16P57768 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX16P57768 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX16P57768 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX16P57768 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX16P57768 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX16P57768 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX16P57768 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX16P57768 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX16P57768 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX16P57768 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX16P57768 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX16P57768 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX16P57768 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX16P57768 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX16P57768 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX16P57768 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX16P57768 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX16P57768 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX16P57768 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX16P57768 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX16P57768 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX16P57768 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX16P57768 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX16P57768 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX16P57768 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX16P57768 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX16P57768 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX16P57768 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX16P57768 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX16P57768 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX16P57768 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX16P57768 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX16P57768 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX16P57768 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX16P57768 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX16P57768 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX16P57768 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX16P57768 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX16P57768 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX16P57768 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX16P57768 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX16P57768 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX16P57768 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX16P57768 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX16P57768 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX16P57768 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX16P57768 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX16P57768 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX16P57768 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX16P57768 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX16P57768 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms