Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX10P56693 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX10P56693 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX10P56693 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX10P56693 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX10P56693 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX10P56693 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX10P56693 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX10P56693 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX10P56693 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX10P56693 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX10P56693 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX10P56693 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX10P56693 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX10P56693 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SOX10P56693 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SOX10P56693 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX10P56693 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX10P56693 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX10P56693 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX10P56693 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX10P56693 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX10P56693 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX10P56693 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX10P56693 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX10P56693 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX10P56693 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX10P56693 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX10P56693 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX10P56693 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX10P56693 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX10P56693 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX10P56693 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX10P56693 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX10P56693 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX10P56693 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX10P56693 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX10P56693 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX10P56693 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX10P56693 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX10P56693 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX10P56693 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX10P56693 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX10P56693 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX10P56693 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX10P56693 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX10P56693 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX10P56693 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX10P56693 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX10P56693 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX10P56693 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX10P56693 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX10P56693 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX10P56693 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX10P56693 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX10P56693 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX10P56693 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX10P56693 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX10P56693 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX10P56693 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX10P56693 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX10P56693 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX10P56693 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX10P56693 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX10P56693 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX10P56693 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX10P56693 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX10P56693 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX10P56693 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX10P56693 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX10P56693 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX10P56693 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX10P56693 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX10P56693 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX10P56693 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX10P56693 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX10P56693 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX10P56693 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX10P56693 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX10P56693 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX10P56693 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX10P56693 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX10P56693 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms