Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RRP1P56182 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP1P56182 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP1P56182 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP1P56182 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RRP1P56182 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP1P56182 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP1P56182 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP1P56182 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP1P56182 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP1P56182 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RRP1P56182 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP1P56182 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP1P56182 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RRP1P56182 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP1P56182 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP1P56182 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP1P56182 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP1P56182 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RRP1P56182 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP1P56182 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP1P56182 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RRP1P56182 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP1P56182 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP1P56182 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP1P56182 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP1P56182 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP1P56182 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RRP1P56182 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RRP1P56182 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP1P56182 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP1P56182 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP1P56182 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP1P56182 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP1P56182 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RRP1P56182 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP1P56182 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP1P56182 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP1P56182 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RRP1P56182 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP1P56182 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP1P56182 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RRP1P56182 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RRP1P56182 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP1P56182 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RRP1P56182 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP1P56182 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP1P56182 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP1P56182 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP1P56182 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP1P56182 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RRP1P56182 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RRP1P56182 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP1P56182 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP1P56182 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.51■■■□□ 2
RRP1P56182 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RRP1P56182 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP1P56182 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP1P56182 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP1P56182 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP1P56182 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP1P56182 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP1P56182 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP1P56182 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP1P56182 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP1P56182 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP1P56182 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP1P56182 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP1P56182 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP1P56182 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP1P56182 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP1P56182 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP1P56182 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP1P56182 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP1P56182 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP1P56182 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP1P56182 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP1P56182 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP1P56182 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP1P56182 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP1P56182 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP1P56182 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP1P56182 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP1P56182 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP1P56182 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms