Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL23P55773 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL23P55773 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL23P55773 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL23P55773 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL23P55773 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL23P55773 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL23P55773 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL23P55773 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCL23P55773 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCL23P55773 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL23P55773 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL23P55773 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL23P55773 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL23P55773 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL23P55773 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL23P55773 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL23P55773 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL23P55773 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL23P55773 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL23P55773 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL23P55773 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL23P55773 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL23P55773 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL23P55773 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL23P55773 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL23P55773 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL23P55773 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL23P55773 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL23P55773 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL23P55773 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL23P55773 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL23P55773 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL23P55773 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL23P55773 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL23P55773 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL23P55773 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL23P55773 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL23P55773 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL23P55773 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL23P55773 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL23P55773 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL23P55773 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL23P55773 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL23P55773 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL23P55773 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL23P55773 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL23P55773 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL23P55773 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL23P55773 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL23P55773 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms