Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AIF1P55008 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AIF1P55008 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AIF1P55008 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AIF1P55008 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AIF1P55008 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AIF1P55008 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AIF1P55008 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AIF1P55008 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AIF1P55008 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AIF1P55008 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AIF1P55008 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AIF1P55008 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AIF1P55008 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AIF1P55008 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AIF1P55008 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AIF1P55008 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AIF1P55008 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AIF1P55008 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AIF1P55008 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AIF1P55008 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AIF1P55008 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AIF1P55008 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AIF1P55008 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIF1P55008 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIF1P55008 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIF1P55008 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIF1P55008 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AIF1P55008 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIF1P55008 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIF1P55008 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIF1P55008 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AIF1P55008 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIF1P55008 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIF1P55008 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIF1P55008 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIF1P55008 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AIF1P55008 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AIF1P55008 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AIF1P55008 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AIF1P55008 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AIF1P55008 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AIF1P55008 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AIF1P55008 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AIF1P55008 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AIF1P55008 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AIF1P55008 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AIF1P55008 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AIF1P55008 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIF1P55008 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIF1P55008 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIF1P55008 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIF1P55008 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIF1P55008 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIF1P55008 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIF1P55008 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIF1P55008 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIF1P55008 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIF1P55008 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIF1P55008 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIF1P55008 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AIF1P55008 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AIF1P55008 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AIF1P55008 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms