Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP98P52948 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP98P52948 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP98P52948 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP98P52948 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP98P52948 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP98P52948 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP98P52948 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP98P52948 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP98P52948 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP98P52948 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP98P52948 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP98P52948 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP98P52948 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP98P52948 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP98P52948 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP98P52948 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP98P52948 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP98P52948 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP98P52948 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP98P52948 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP98P52948 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP98P52948 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP98P52948 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP98P52948 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP98P52948 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP98P52948 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP98P52948 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP98P52948 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP98P52948 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP98P52948 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP98P52948 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP98P52948 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP98P52948 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP98P52948 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP98P52948 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP98P52948 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP98P52948 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUP98P52948 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP98P52948 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP98P52948 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP98P52948 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP98P52948 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP98P52948 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP98P52948 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP98P52948 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP98P52948 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP98P52948 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP98P52948 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP98P52948 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP98P52948 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP98P52948 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP98P52948 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP98P52948 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP98P52948 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP98P52948 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP98P52948 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP98P52948 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP98P52948 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP98P52948 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP98P52948 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP98P52948 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP98P52948 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP98P52948 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP98P52948 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP98P52948 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP98P52948 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP98P52948 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP98P52948 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP98P52948 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP98P52948 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP98P52948 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP98P52948 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP98P52948 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP98P52948 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP98P52948 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP98P52948 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP98P52948 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP98P52948 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP98P52948 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP98P52948 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP98P52948 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP98P52948 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms