Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THOP1P52888 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THOP1P52888 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THOP1P52888 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THOP1P52888 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THOP1P52888 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THOP1P52888 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THOP1P52888 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THOP1P52888 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THOP1P52888 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THOP1P52888 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THOP1P52888 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
THOP1P52888 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THOP1P52888 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THOP1P52888 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THOP1P52888 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THOP1P52888 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THOP1P52888 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THOP1P52888 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THOP1P52888 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THOP1P52888 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THOP1P52888 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THOP1P52888 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THOP1P52888 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THOP1P52888 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THOP1P52888 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THOP1P52888 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
THOP1P52888 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
THOP1P52888 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
THOP1P52888 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
THOP1P52888 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
THOP1P52888 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
THOP1P52888 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
THOP1P52888 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THOP1P52888 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THOP1P52888 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THOP1P52888 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THOP1P52888 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THOP1P52888 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THOP1P52888 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THOP1P52888 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THOP1P52888 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THOP1P52888 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THOP1P52888 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THOP1P52888 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THOP1P52888 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THOP1P52888 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THOP1P52888 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
THOP1P52888 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THOP1P52888 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
THOP1P52888 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THOP1P52888 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
THOP1P52888 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
THOP1P52888 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THOP1P52888 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
THOP1P52888 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
THOP1P52888 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THOP1P52888 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THOP1P52888 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THOP1P52888 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THOP1P52888 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THOP1P52888 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THOP1P52888 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THOP1P52888 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THOP1P52888 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THOP1P52888 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THOP1P52888 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THOP1P52888 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
THOP1P52888 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THOP1P52888 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms