Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms