Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE2E1P51965 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms