Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCNKBP51801 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCNKBP51801 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms