Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DAP3P51398 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DAP3P51398 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DAP3P51398 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DAP3P51398 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DAP3P51398 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DAP3P51398 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DAP3P51398 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DAP3P51398 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DAP3P51398 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DAP3P51398 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DAP3P51398 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DAP3P51398 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DAP3P51398 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DAP3P51398 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DAP3P51398 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DAP3P51398 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DAP3P51398 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DAP3P51398 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DAP3P51398 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DAP3P51398 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DAP3P51398 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DAP3P51398 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DAP3P51398 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DAP3P51398 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DAP3P51398 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DAP3P51398 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DAP3P51398 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DAP3P51398 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DAP3P51398 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DAP3P51398 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DAP3P51398 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DAP3P51398 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DAP3P51398 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DAP3P51398 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DAP3P51398 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DAP3P51398 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DAP3P51398 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DAP3P51398 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DAP3P51398 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DAP3P51398 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DAP3P51398 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DAP3P51398 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DAP3P51398 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DAP3P51398 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DAP3P51398 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DAP3P51398 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DAP3P51398 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms