Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms