Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFBP49765 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms