Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTAP49354 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTAP49354 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTAP49354 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTAP49354 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTAP49354 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTAP49354 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTAP49354 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTAP49354 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTAP49354 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTAP49354 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTAP49354 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTAP49354 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTAP49354 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTAP49354 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTAP49354 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTAP49354 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTAP49354 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTAP49354 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTAP49354 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTAP49354 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTAP49354 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTAP49354 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTAP49354 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTAP49354 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTAP49354 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FNTAP49354 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FNTAP49354 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTAP49354 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTAP49354 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTAP49354 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTAP49354 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTAP49354 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTAP49354 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTAP49354 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTAP49354 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTAP49354 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTAP49354 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTAP49354 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTAP49354 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTAP49354 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTAP49354 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTAP49354 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTAP49354 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTAP49354 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTAP49354 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTAP49354 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTAP49354 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTAP49354 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTAP49354 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTAP49354 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTAP49354 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTAP49354 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTAP49354 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTAP49354 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTAP49354 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTAP49354 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTAP49354 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTAP49354 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTAP49354 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTAP49354 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTAP49354 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTAP49354 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTAP49354 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTAP49354 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNTAP49354 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms